결론은 EOS M3 가 이상합니다. 제가 가지고 있는 EOS M3 만 그런 것인지도 모르겠습니다.
캐논 AS 센터에 M2 와 M3, 18-55mm IS STM 렌즈 모두 가지고 가서 이야기해볼 생각입니다.  

18-55mm IS STM 의 55mm 구간에서 EOS M2 와 EOS M3 의 비교 테스트를 굉장히 많이 해 보았습니다.
EOS M2 경우 1/20 초로 촬영하면 IS ON 과 IS OFF 에 따른 차이가 확연합니다.
IS ON 경우 흔들리지 않은 사진이 대부분 찍히고 IS OFF 하면 대부분 흔들려서 찍힙니다.
EOS M3 경우에는 IS ON 이나 IS OFF 나 큰 차이가 없이 대부분 흔들려서 찍힙니다.

그러나 EOS M3 경우에도 셔터속도가 1/5초 정도로 느려지면  IS ON 과 IS OFF 의 차이가 제법 나타납니다.  
그래서 앞서 보여드린 사진처럼 EOS M3 에 10-18mm IS STM 렌즈를 사용하는 경우 셔터속도를 1/5 초이하로 하면 IS 기능이 확인 됩니다.

EOS M3  경우 셔터를 누르는 순간 IS 기능이 잠시 OFF 되었다가 ON 되어 기능에 문제가 발생하는 것이 아닌가 하는 생각이 들기도 하지만 이유는 알 길이 없습니다.
어쨋든 제가 가지고 있는 EOS M3 와 EF-S 18-55mm 렌즈를 같이 사용하는 경우 IS 기능이 제대로 구현되지 않는 것은 확실합니다.
EOS M2 에서 IS 기능이 정상인 것으로 봐서는 18-55mm IS STM 렌즈의 문제는 아닌 것으로 판단됩니다.

앞서 말씀드린 것 처럼 시그마 17-50mm F/2.8 렌즈는 EOS M3 에서도 IS 기능이 잘 됩니다.  
또한 EOS M2 에 18-55mm IS STM 렌즈를 연결하면 시그마렌즈에 떨어지지 않는 성능으로 IS 기능이 잘 됩니다.
EOS M3 에서만 IS 기능에 문제가 있습니다.

다른 분들의 경우 EOS M3 사용시 55mm , 1/20 초에서 IS ON/OFF 차이가 확연하게 나는지 궁금합니다.
펌웨어 버젼 1.0.1 입니다. (펌웨어 1.0.0 에서는 IS 가 잘 될지도 모르겠습니다.)


추가 : EOS M3  에서 55mm 1/20 초 IS ON 상태에서 연사로 촬영하니 5장중 처음과 마지막 사진을 제외하고 항상 깨끗하게 찍힙니다. 
 IS OFF 상태에서 연사로 촬영하면 5장 대부분 흔들려서 찍힙니다. ( 참고로 5장 연사의 마지막 사진은 4장을 연속으로 찍은후 잠시 멈추었다가 다시 찍힙니다.)