COOLPIX S6400은 슬림하며 컴팩트한 바디 디자인에 300mm상당의 화각으로 촬영이 가능한 광학 12배 망원 줌 기능이 탑재되었다. 광시야각 7.62cm(3형) 터치 액정 모니터 채용했으며 어안, 토이 카메라, 미니어쳐, 팝 효과 등 19개 패턴으로 총 30가지의 다양한 효과를 적용할 수 있다. 16.02메가 픽셀의 이미지 센서를 장착했으며, 고감도 ISO 3200을 지원한다.

동영상 촬영 시에는 원하는 장면을 나눠 찍고, 하나의 파일로 저장할 수 있는 새로운 기능을 갖췄다.